RESUMEN: El objetivo del presente estudio fue evaluar el nivel de cumplimiento de estándares mínimos del Sistema de Gestión de Seguridad y Salud en el Trabajo en el marco de la pandemia COVID-19, causada por el coronavirus SARS-CoV-2, en empresas de Medellín de tres sectores económicos: construcción, manufactura y salud. Método: se realizaron auditorías al Sistema de Gestión de Seguridad y Salud en el Trabajo de seis empresas a través de entrevistas semiestructuradas, en las que se aplicó lista de verificación de estándares mínimos de acuerdo con la Resolución 0312 de 2019, emitida por el Ministerio del Trabajo de Colombia. Para el análisis estadístico se compararon las variables sector económico frente al porcentaje de cumplimiento de los estándares mínimos. Resultados: el sector económico salud presentó un mayor porcentaje de cumplimiento del sistema de gestión en el contexto de la pandemia, comparado con empresas de construcción y manufactura. Entre los grupos salud y manufactura se obtuvo una diferencia estadísiticamente significativa; mientras que, al comparar los grupos construcción y salud, manufactura y construcción, dio como resultado medias iguales. Conclusiones: los sectores económicos construcción, manufactura y salud presentaron al año 2020 un cumplimiento parcial de estándares mínimos, a la luz de lo reglamentado en la Resolución 0312 de 2019 del Ministerio del Trabajo. El sector salud presentó el porcentaje más alto de cumplimiento, seguido por construcción y manufactura.