En el presente estudio de caso, resultado de la aplicación del diplomado de sistema de gestión integrado en seguridad alimentaria y calidad, bajo lineamientos BPM y HACCp, se llevó a cabo un exhaustivo diagnóstico en la Asociación de Pequeños Caficultores del Corregimiento de La Marina. Se utilizaron diversas herramientas de análisis, como la matriz VESTER, el análisis de las 6 M ́s (Materiales, Mano de obra, Método, Medio ambiente, Medición y Maquinaria), y la evaluación de stakeholders, entre otras, para identificar los hallazgos más significativos. Entre estos, se destacan los desafíos en la gestión de calidad, planificación, comunicación interna y capacitación. Como resultado, se proponen recomendaciones claves, como la implementación de programas de capacitación continua y la integración cuidadosa de los sistemas de gestión de la organización. Estas acciones buscan mejorar la efectividad y eficiencia del sistema de gestión de ASOPECAM, fortaleciendo así su posición en el competitivo mercado del café.