El presente trabajo identifica los vacíos de conocimiento a través del análisis de los inventarios de biodiversidad del Sistema Regional de Áreas Protegidas Eje Cafetero (SIRAP EC). Para ello, se determinaron vacíos de información geográficos, se determinó la representatividad y distribución de los inventarios de biodiversidad en el SIRAP EC, así como su distribución por departamento y por área protegida. También se identificaron los vacíos de información referente a los grupos biológicos de la Ecorregión Eje Cafetero. Incluyendo las aves, anfibios, mamíferos, reptiles, peces, insectos, hongos y plantas. Esto permitió concluir acerca de los grupos biológicos subrepresentados del SIRAP EC. Los inventarios de biodiversidad analizados provienen del Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia (SIB Colombia) y algunos de la Base de Datos de Investigaciones del SIRAP EC. Estos comprenden un periodo de cobertura para los registros de especies desde 1193 hasta el 2019. Las áreas protegidas incluidas en el análisis corresponden a las presentes en el SIRAP EC excluyendo las Reservas Naturales de la Sociedad Civil. Para las 78 áreas protegidas incluidas se identificaron los vacíos de información y fueron clasificada según los criterios de presencia o ausencia de: inventarios de biodiversidad, registros de especies y especies indicadores inventariadas...