Aunque existen diferentes tecnologías para el tratamiento de aguas residuales, son pocas las que son eficientes en la remoción de organismos patógenos. La gran mayoría son eficientes en la remoción de materia orgánica y otros compuestos, sin embargo son limitadas frente a organismos patógenos. En los últimos años se han promovido los sistemas naturales como alternativa para la remoción de organismos patógenos, caracterizados principalmente por sus bajos costos de operación y mantenimiento, simplicidad de operación y la ausencia de compuestos intermedios o subproductos indeseables. Dentro de la gran gama de sistemas naturales se destacan los humedales construidos, los cuales han sido objeto de investigación en condiciones subtropicales o países con régimen estacional. Los resultados obtenidos en esos trabajos confirman la bondad de estos sistemas, sin embargo falta desarrollar actividades de investigación y aplicación en condiciones tropicales. Así mismo, se ha sugerido que una forma de reducir área y por consiguiente costos de los sistemas, es la combinación de humedales de diferentes características, en especial para la remoción de patógenos.En este orden se evaluaron diferentes combinaciones de humedales construidos como una posible tecnología para la remoción de patógenos: Humedal de flujo Horizontal - Humedal de flujo Horizontal (H-H); Humedal de flujo Vertical - Humedal de flujo Vertical (V-V); Humedal de flujo Vertical - Humedal de flujo Horizontal (V-H), todos ellos plantados y sin plantar, para un total de seis unidades experimentales. Las unidades experimentales se localizaron en la Planta de Tratamiento de Aguas Residuales de la Universidad Tecnológica de Pereira. Después de una evaluación cercana a un año, la combinación de humedales construidos de flujo Vertical-Horizontal presentaron los mayores rendimientos en la remoción de Coliformes Totales (3 unidades log), E. Coli (4 unidades Log) y Huevos de Helmintos (90%). En adición, se evaluó la remoción DBO5, DQO, SST y nitrógeno en las diferentes unidades experimentales. En remoción de materia orgánica expresada como DBO5 y DQO las remociones fueron superiores al 85% en todas las unidades, sin embargo no se presentaron diferencias significativas entre ellas. En cuanto a nitrógeno, la combinación de humedales construidos Vertical-Horizontal presentó los mayores rendimientos para estos parámetros (remociones superior al 90%), destacándose diferencias significativas entre las unidades plantadas y las sin plantar. Las unidades plantadas presentaron mayores tasas de remoción. La combinación de nitrificación (en las unidades verticales) con la denitrificación (unidades de flujo horizontal) es sugerido como el principal mecanismo de remoción de nitrógeno. Los resultados obtenidos permiten concluir que el uso de dos unidades de Humedales construidos bajo la configuración flujo vertical - flujo horizontal operando bajo condiciones tropicales presenta altas tasas de remoción y permite que el efluente tratado cumpla con los estándares establecidos para reuso.