En el municipio de Alcalá, Valle del cauca, se evaluó la calidad biológica del agua con macroinvertebrados acuáticos, para dos temporadas de muestreo (sequía y lluvias) en cinco estaciones de la microcuenca Los Ángeles. La calidad del agua fue estudiada utilizando el índice BMWP adaptado para Colombia; además se registraron las áreas de protección y se realizó Análisis de Componentes Principales (ACP) para buscar relaciones entre macroinvertebrados acuáticos y características del entorno de las estaciones de muestreo. También a partir del diálogo con los pobladores locales se analizaron las motivaciones, percepciones y se concertaron algunas propuestas de acciones para la gestión de la microcuenca. En las cinco estaciones muestreadas se obtuvieron valores del índice equivalentes a buena calidad biológica; sin embargo en la temporada de lluvias se observaron cambios, debido a la disminución de los macroinvertebrados en los sitios donde la protección inmediata fue distinta de relicto de selva (Estaciones La Polonia y La Floresta). También se encontró que las estaciones protegidas por relicto de selva en el lugar de muestreo, presentaron mejores condiciones ecológicas en las dos temporadas por la dominancia de organismos sensibles; mientras en las estaciones con otros sistemas de protección, predominaron los acroinvertebrados de familias algo tolerantes a la contaminación. La bioindicación con macroinvertebrados acuáticos y la aplicación de metodologías participativas, permitió el reconocimiento del saber local asociado con la biodiversidad del agua, la historia de los procesos de transformación del paisaje, y la problemática del recurso hídrico; facilitando la formulación de acciones para el mejoramiento del sistema territorial.