Introducción: Este estudio analiza la relación entre la altitud y las tasas de mortalidad por enfermedades cardiovasculares y respiratorias en Colombia entre 2000 y 2019. Se investiga si vivir en municipios de elevada altitud (>2500 msnm) se asocia con diferencias en la mortalidad en comparación con municipios de baja altitud (<1000 msnm), controlando factores como el sexo, la edad, y estatus socioeconómico. Métodos utilizados: Se empleó un diseño ecológico que incluyó el emparejamiento de municipios de alta y baja altitud. Se calcularon tasas de mortalidad ajustadas por el método directo, razones de mortalidad estandarizadas (RME) y se realizó un análisis de regresión de Poisson para estimar riesgos ajustados, considerando causas de muerte cardiovasculares y respiratorias que reportaban relación con la altitud de acuerdo con estudios previos. Resultados principales: Los municipios de elevada altitud mostraron menores indicadores de mortalidad por enfermedades cardiovasculares, como infarto agudo de miocardio e insuficiencia cardíaca, pero mayores tasas por hipertensión pulmonar y enfermedades respiratorias crónicas. Conclusiones: Vivir en altitudes elevadas en Colombia se asocia con una menor mortalidad por algunas enfermedades cardiovasculares, pero un mayor riesgo de hipertensión pulmonar y enfermedades respiratorias crónicas. Estos hallazgos sugieren efectos beneficiosos y adversos de la altitud sobre la salud, destacando la necesidad de políticas de salud pública adaptadas a las condiciones geográficas.