El conocimiento que poseen los pueblos amazónicos sobre los ciclos ecológicos del bosque húmedo tropical, ha derivado en el desarrollo de sistemas productivos que permiten el establecimiento de relaciones armónicas entre las comunidades locales y su entorno. Debido a la incidencia de motores de cambio socioeconómico y biofísico, el conocimiento ecológico tradicional (CET) asociado a los sistemas indígenas de producción ha venido transformándose a lo largo del tiempo, provocando variaciones en la composición, configuración y función de las chagras. Esta investigación indagó sobre las transformaciones en el CET y su reflejo en las chagras, a través de un estudio de caso en el resguardo indígena El Vergel, Amazonas. El estudio combinó datos cuantitativos obtenidos de la caracterización de los componentes social y ecológico de las chagras y la categorización de los factores impulsores de cambio, así como datos cualitativos relacionados con la descripción de los niveles del CET y del examen de sus variaciones en los últimos cuarenta años (1976-2016). El análisis del CET evidenció diferencias tanto entre los saberes de las familias de cada chagra, como entre niveles y escalas. Los cambios de las chagras se manifestaron en la dimensión funcional y en la dimensión temporal, expresando transformaciones en la composición de especies y variedades cultivadas, así como en el mantenimiento de las fases y tiempos de manejo necesarios para completar su ciclo. Poner en diálogo diferentes sistemas de conocimiento aporta al debate sobre los modelos de uso y conservación de los ecosistemas amazónicos, y a la recuperación de los saberes asociados a los sistemas indígenas de producción que contienen elementos clave sobre el manejo de los bosques. La investigación identificó elementos de interés para la conservación que contribuyen a definir la chagra amazónica desde una perspectiva socioecológica y revalorarla como sistema adaptativo, aportando a la comprensión de las relaciones entre sociedad y naturaleza en la Amazonía colombiana.