A través del desarrollo del proyecto Magdalena Centro Caldense: Patrimonio Biocultural se hizo un estado del arte sobre la diversidad biológica de la región, encontrando hasta el momento 947 especies de flora vascular y 1058 especies fauna. De estas, alrededor de 100 especies de la región están bajo alguna categoría de amenaza según la Unión Internacional para la Conservación de la Biodiversidad (UICN). De acuerdo con los distintos grupos taxonómicos, 209 corresponden a la ictiofauna, donde al menos 27 se encuentran amenazadas. Con respecto a la herpetofauna, 134 son anfibios, de los cuales 23 están amenazados, mientras que de reptiles se encuentran 139 especies la mayoría en preocupación menor y tres amenazadas. En aves se han reportado 528 especies, con 18 en categoría de amenaza. Por último, en mamíferos medianos y grandes se han reportado 48 especies, de las cuales 12 están bajo alguna categoría de amenaza.