Leptospira spp es una bacteria, que pertenece a la familia de las espiroquetas y tiene varias serovares causantes de diferentes enfermedades reproductivas en el ganado bovino de doble propósito, al igual que lo hace el protozoario Neospora caninum. Ambos son causantes de abortos, infertilidad, mortinatos y animales débiles, lo cual hace parte de los principales problemas que afectan la economía ganadera del país. Teniendo como objetivo la identificación de los factores de riesgo y la prevalencia de enfermedades en bovinos infectados por Neospora caninum y Leptospira spp en Rio de Oro y Aguachica. Para la determinación de la seroprevalencia, se utilizaron las pruebas MAT y ELISA Leptospira spp y Neospora caninum respectivamente. Adicionalmente se realizó una encuesta epidemiológica donde se incluían preguntas acerca de la estructura poblacional como lo era el sexo, grupo etario, además de las condiciones de manejo y plan sanitario entre las que se incluían variables como vacuna de Leptospira, cadena de frio, uso de aguja individual, agalactias, etc. para determinar factores de riesgo. Se encontró una prevalencia del 24.1% para Leptospira spp y para Neospora caninum del 18.4%, y se identificaron diferentes factores de riesgo como fuente de agua, alimentación, presencia de perros, abortos, retenciones placentarias y muertes fetales. Concluyendo de esta manera que se debe tener más control en los factores de riesgo encontrados y resaltar que es importante que realicen más estudios con el fin de entender la epidemiologia de la enfermedad y disminuir la prevalencia de estos microorganismos en Colombia.