Durante los últimos años, la secuenciación del exoma completo ha tenido una gran aceptación para la evaluación de trastornos genéticos. Gracias al acceso a la secuenciación de siguiente o nueva generación (NGS), a las herramientas bioinformáticas y a los expertos profesionales, estas pruebas moleculares representan una herramienta diagnóstica de primera línea para muchas enfermedades genéticas. El objetivo de este estudio fue determinar el rendimiento diagnóstico de la secuenciación de exoma en trio e individual en un grupo de pacientes colombianos con sospecha clínica de enfermedad genética monogénica, así como el rendimiento diagnóstico por grupos de fenotipos, entre junio de 2020 y mayo de 2021. Se realizó un estudio descriptivo transversal, retrospectivo, aprobado por el comité de ética en investigación. Se revisaron las historias clínicas para obtener los datos clínicos y fenotípicos, y se realizó secuenciación de exoma completo en trio. El llamado de variantes se realizó utilizando las mejores prácticas de GATK, con la posterior anotación y filtrado utilizando términos de Human Phenotype Ontology (HPO) y las variantes se clasificaron utilizando las directrices del Colegio Americano de Genética Médica y Genómica (ACMG, por sus siglas en inglés) de 2015. Se realizaron análisis tanto de exoma individual como análisis de exoma en trio en cada caso. Los casos se consideraron positivos cuando se identificaron variantes patogénicas (P) o probablemente patogénicas (PP), con un mecanismo de herencia que explicaba el fenotipo del paciente. Además, los casos se estratificaron por grupos según el fenotipo clínico, para evaluar el rendimiento específico de la prueba. Se incluyeron un total de 100 casos. La edad media fue de 8.6 años, y siete casos eran hijos de padres consanguíneos. El rendimiento diagnóstico fue del 29% para el análisis de exomas únicos y del 32% para el análisis en trio. Entre los casos positivos, el 19% presentaba una enfermedad autosómica dominante, el 8% una enfermedad ligada al cromosoma X, el 4% una enfermedad autosómica recesiva y el 1% un trastorno de herencia digénica. Dos casos tenían hallazgos incidentales en los genes PMS2 y MSH6, y otros dos casos tenían condiciones monogénicas concomitantes. El fenotipo más prevalente fue el retraso del neurodesarrollo en el 47% de los individuos, con un rendimiento del 38.3%. El mayor rendimiento se encontró en la parálisis (71.3%), seguido de la hipoacusia (55.5%), la microcefalia (50%), la hipertensión pulmonar (50%) y las alteraciones hematológicas (50%). Los movimientos anormales tuvieron la tasa de diagnóstico más baja (10%). Este estudio mostró un rendimiento 3% mayor para el análisis del exoma en trío en comparación con el individual. Esto se explica principalmente por la identificación de variantes de novo y mutaciones heterocigotas compuestas confirmadas, que no pueden establecerse en los exomas únicos. El exoma trio mostró el mejor rendimiento en los fenotipos neurológicos, especialmente en individuos con parálisis. (Texto tomado de la fuente).