En esta investigación se abordan las habilidades de pensamiento crítico (HPC) en los profesores de ciencias en formación inicial (PCFI) desde estrategia didáctica centrada en las representaciones sociales (RS) de las reacciones químicas y su relación con los conceptos químicos, sus implicaciones sociales y ambientales para analizar las distintas controversias que se generan a partir de esta situación. Las HPC son relevantes en la formación profesional de los PCFI, éstas le permiten al docente conocer e interactuar con contextos y ambientes teórico-prácticos de la enseñanza, ellas promueven una enseñanza que cubra las diferentes perspectivas, necesidades y campos de acción. Reconocer las representaciones sociales de la química, entendidas como la relación entre el individuo ya sea estudiante o profesor y la temática que se está abordando, el cómo este escribe, representa o sustenta un concepto o un tema relacionado con el campo en específico. Al articular estas dos perspectivas se genera un campo de investigación interrelacionado, en el que se indaga por dichas habilidades y su desarrollo en el profesor de ciencias en formación inicial cuando se trabaja reacciones químicas a partir de sus representaciones sociales al respecto. Teniendo en cuenta esto, se realizó el trabajo investigativo sobre el desarrollo de las habilidades pensamiento crítico en torno a la argumentación, el análisis y la resolución de problemas en cuanto a las representaciones sociales de los profesores de ciencias en formación inicial frente a las reacciones químicas, el desarrollo de una práctica de laboratorio, teniendo en cuenta su fase previa, su proceso y finalización en cuanto a las reacciones químicas, en este caso el impacto ambiental de las mismas relacionadas con la química verde y las energías alternativas.