Teniendo en cuenta los diferentes estudios desarrollados principalmente en América del Sur sobre emisiones atmosféricas producidas por reservorios, se determina que las centrales hidroeléctricas emiten gases efecto invernadero (GEI) a la atmósfera (de Lucena, Schaeffer, & Szklo, 2010; Demarty & Bastien, 2011; Rocha Lessa, dos Santos, Lewis Maddock, & Santos Bezerra, 2015; Soito & Freitas, 2011; Weisser, 2007; Yang et al., 2014; Zhang et al., 2015), que tienen incidencia sobre el calentamiento global y el cambio climático. De este modo, por medio de la metodología aportada por el panel intergubernamental para el cambio climático sobre la estimación de emisiones de gases de efecto invernadero provenientes de tierras convertidas en tierras permanentemente inundadas IPCC(2006), se estimaron las emisiones difusoras de dióxido de carbono (CO2) y metano (CH4) producidas por los principales embalses de las centrales hidroeléctricas en Colombia, generando valores de emisión, comparando las emisiones calculadas entre las hidroeléctricas del país y con otros modos de generación eléctrica en Colombia. Las emisiones difusoras de CO2 y CH4 calculadas con la metodología propuesta por el IPCC se estimaron en 773 Gg CO2 año-1 y de 10,78 Gg CH4 año-1, lo que equivale a una emisión total de 1.042,5 Gg CO2-Eq año-1 (1.042.500 t CO2-Eq año-1), que representa el 4,4 % del total de emisiones generadas por el sector eléctrico colombiano (23.458.556,28 t CO2-Eq año-1); confirmando que los embalses hidroeléctricos estudiados generan emisiones GEI que no se están teniendo en cuenta dentro de los inventarios nacionales de emisiones atmosféricas y aunque no son relevantes al compáralos con otras fuentes generadoras de energía en el país, están contribuyendo al calentamiento global. En Colombia se recomienda la elaboración y ejecución de un modelo que cuantifique las emisiones de cualquier embalse para conocer el estado real de las emisiones de GEI por parte de los reservorios existentes, estableciendo medidas de mitigación adecuadas para reducir sus aportes al calentamiento global.