En Colombia con la imposición del modelo de desarrollo industrial como única alternativa para combatir los problemas de la sociedad, se impulsó un sistema de producción a gran escala, altamente tecnificada con requerimientos de alta productividad, lo que requirió el uso excesivo de fertilizantes y pesticidas que generaron el desplazamiento de los sistemas tradicionales generando desequilibrios en los ecosistemas, pérdida de biodiversidad y degradación de los suelos. Los sistemas productivos cafeteros han sido uno de los cultivos más tecnificados y con transformaciones biofísicas y socioculturales. Por lo anterior, con el fin de conocer los servicios ecosistémicos generados por la agrobiodiversidad en sistemas productivos cafeteros se evaluaron 15 agroecosistemas del municipio de Belén de Umbría, Risaralda, se realizó la adaptación del Índice de Diversidad del Agroecosistema (IDA) para identificar los usos de la agrobiodiversidad, identificación de los servicios ecosistémicos asociados a los tipos de agrobiodiversidad y se clasificaron de acuerdo a las categorías propuestas por La Evaluación de los Ecosistemas del Milenio, posteriormente se aplicó la metodología de Jerarquización y Calificación con el fin de conocer las percepciones que tienen los productores sobre los servicios ecosistémicos. Por último, se definió una ruta metodológica para la valoración ecológica de los servicios ecosistémicos generados por la agrobiodiversidad a través de dos etapas: diagnóstica y de análisis y clasificación de los servicios ecosistémicos.