La bioprospección o de la biodiversidad, se define como la búsqueda, elección e investigación metodológica de nuevaprospección s fuentes de compuestos químicos, genes, proteínas y otros productos a los cuales se les puede sacar un usufructo, y que se encuentran en diversos ambientes naturales alrededor del mundo. (O. Duarte Torres, 2011a) Investigaciones realizadas permiten conocer el avance de la bioprospección entorno al tratamiento de las aguas residuales por medio de bacterias, hongos, algas y plantas, dichas investigaciones permiten observar escenarios potenciales para desarrollar biotratamientos en las aguas residuales de Colombia. (Cerón, Leal, & Nassar, 2009) Colombia es reconocida como un país megadiverso, lo cual representa un potencial para el uso y aprovechamiento de sus recursos para implementar biotratamientos. El modelo tradicional de desarrollo de sectores productivos asociados a la biodiversidad ha generado la disminución de los recursos afectando la conservación de estos mismos para un futuro, ya que están planteados dentro de los paradigmas clásicos de la explotación de la naturaleza para materias primas. Colombia, actualmente tiene la capacidad científica y tecnológica para avanzar de una forma más intensiva en estudios bioprospectivos aplicados al tratamiento de aguas residuales con base a sus hábitats naturales, los cuales son modelos potenciales para el estudio de la diversidad en bacterias, hongos, algas y plantas para ser aprovechados en temas de recuperación hídrica. (Melgarejo, Sánchez, Reyes, Newmark, & Santos-Acevedo, 2002). La presente revisión sistemática se realiza con el fin de conocer el desarrollo actual de la bioprospección aplicada al tratamiento de aguas residuales en el contexto colombiano.