En el Río Chicamocha se encuentran sustancias tóxicas que degradan la naturaleza y la salud pública, por tal fundamento en el siguiente estudio se busca identificar una línea base toxicológica del Río Chicamocha por medio de indicadores biológicos, fisicoquímicos y microbiológicos, que permiten diagnosticar la calidad de este recurso hídrico, que presenta un impacto a causa de las descargas de vertimientos provenientes de usos domésticos e industriales en el sector Vado Castro. La cuenca del río Chicamocha tiene una alta contaminación, además se evidencia la falta de control y de compromiso por parte de las entidades encargadas de llevar a cabo el seguimiento del recurso hídrico y los parámetros de oferta, demanda y calidad (Obando, 2019, pág. 195). El propósito del estudio es evaluar y comparar el estado y la calidad del recurso hídrico por dos metodologías, con bioindicadores e índices de calidad, analizando y verificando que cargas contaminantes se hallan en el sector donde se realiza el estudio y en qué estado se encuentra el río; respecto a la presencia de contaminantes críticos y sustancias tóxicas. Para lograr los objetivos del estudio se realizó una investigación exhaustiva de estudios previos y revisión de caracterizaciones históricas realizadas por Corpoboyacá y firmas consultoras, así como se logró realizar el análisis y monitoreo de algunos parámetros de interés sanitario (Hierro, Nitritos, Fenoles, Potasio, Sodio, Magnesio y Manganeso), con el propósito de revisar las concentraciones de acuerdo a lo reglamentado por la norma Colombiana y establecer con respecto a los datos históricos investigados en fuentes secundarias, si en efecto hay algún cambio o la presencia de estos compuestos químicos se mantiene y en qué concentraciones. Como resultado final del estudio se obtiene la comparación de las metodologías para determinar índices de calidad del agua, por medio de indicadores e índices de calidad, calculados para el Sector Vado Castro, para determinar el estado en que se encuentra la cuenca hídrica. La información necesaria se obtiene por medio del plan de ordenamiento del recurso hídrico de la cuenca alta y media del río Chicamocha para así verificar en qué porcentaje y clasificación se encuentra. Según (Samboni, et al, 2007, pág. 51) Los índices de calidad (ICA) y los índices de contaminación (ICO), se basa en una expresión matemática sencilla y una clasificación para cada índice de calidad, la determinación se hace mediante una combinación de parámetros fisicoquímicos y microbiológicos.