Objetivo: El objetivo de este trabajo fue identificar la presencia de enterobacterias y su tipificación en muestras de placa subgingival de implantes y dientes adyacentes a implantes de pacientes parcial y completamente edéntulos residentes en Bogotá; con diagnóstico de Mucositis y Periimplantitis para posteriormente comparar los resultados. Materiales y Métodos: Participaron 31 pacientes, con un total de 103 implantes de los cuales 91 implantes fueron diagnóstico con Mucositis y 12 diagnostico de Periimplantitis. Tres pacientes de los 31 fueron edéntulos totales y tuvieron diagnostico de Mucositis. No hubo pacientes edéntulos diagnosticados con Periimplantitis. Se tomaron muestras del fondo del surco con puntas de papel estériles, las cuales fueron sembradas en agar MacConkey e identificadas por medio de espectrometría de masas utilizando el sistema MALDI-TOF MS. Los tres microorganismos que se aislaron con mayor frecuencia en pacientes parcialmente edéntulos tanto en dientes como en implantes fueron K. oxytoca, E. cloacae y E. cloacae complex. Una paciente con Periimplantitis tuvo una muestra positiva para Mycoplasma arginini el cual no está reportado como asociado con enfermedad periodontal o periimplantar. En los pacientes edéntulos se aislaron Acinetobacter iwoffii, Stenotophomonas maltophilia y Enterobacter kobei, los cuales están reportados como asociados a enfermedad peridontal y periimplantar. Una paciente con síndrome de Sjögren, la cual presentó diagnóstico de mucositis y un aislamiento de Acinetobacter iwoffii y Stenotophomonas maltophilia. En conclusión, los microorganismos aislados están relacionados con enfermedad periimplantar y periodontal a excepción del Mycoplasma arginini. Al existir coincidencias en el aislamiento de enterobacterias en dientes e implantes se observa que los surcos periodontales pueden servir como reservorio de bacterias la cuales posteriormente pueden colonizar los tejidos periimplantares. La flora oral en pacientes edéntulos puede resultar menos patológica que la que se presenta en pacientes parcialmente edéntuos, debido a los hallazgos en esta estudio. Se recomienda realizar más investigaciones en el tema para lograr definir el papel de las enterobacterias en la enfermedad periimplantar.