En este trabajo se tomó como caso de estudio la quebrada El Mellizo, ubicada en el municipio de Viterbo - Caldas, que en su trayecto de norte a sur por el área urbana, se encuentra canalizada por medio de una estructura hidráulica de tipo box culvert. A partir de la recolección de información espacial y temporal, depurada y procesada por medio del sistema de información geográfica “QGIS”, se determinó el comportamiento hidrológico de la microcuenca y la quebrada de interés, obteniendo así, los caudales de diseño, usados en la reproducción de un modelo cuasi-bidimensional [1D/2D] en el programa “HEC – RAS”, identificando la incidencia del box culvert en las manchas de inundación para diferentes periodos de retorno, bajo distintos escenarios de modelación, los cuales incluyeron la simulación de alternativas con algunas acciones estructurales para mitigar el impacto de la inundación, siendo integrada la delimitación de la zona ribereña como medida no estructural. Con la valoración realizada en este sector, se identificó que el box culvert altera la extensión de la inundación, ya que, al no tener la capacidad para transportar el caudal bajo las condiciones actuales el flujo se represa en el acceso, y posteriormente se desborda sobre el área urbana, constituyendo escenarios de riesgo en la población, siendo necesario integrar medidas estructurales, la reconversión en los usos del suelo, la protección y el control territorial de las áreas de interés ambiental y de las zonas de riesgo.