El presente documento analiza el papel innovador de los fondos concursales como innovación institucional para la asignación de recursos públicos a iniciativas privadas, mediante una metodología de observación participativa de los proyectos ejecutados como resultado de las convocatorias públicas realizadas por el IICA durante los años 2007 a 2009 en todo el territorio Nacional Colombiano, para proyectos de pequeña irrigación, con lo cual se pudo determinar le eficiencia y la eficacia del sistema concursal frente a los métodos tradicionales en cuanto a tiempo de ejecución, costos de transacción y resultados tangibles; y los inconvenientes de los mismos por su sensibilidad política y la dificultad de articulación de los diversos programas de desarrollo agropecuario.