Se planteó como objetivo el determinar la presencia de amebas de vida libre en aguas de fuentes públicas de Santiago de Cali. Se recolectaron, aproxi-madamente, dos litros de agua de diferentes fuentes públicas, registrando el pH y la temperatura. Se realizó montaje de cada muestra para búsqueda en directo. También se filtró independientemente cada muestra a través de membranas (poro de 0,45 μm de diámetro), y se incubaron en agar no nutritivo a 37 ºC con solución de Page y Escherichia coli inactivada durante siete días. Diariamente se analizó por microscopía de luz convencional la morfología de las amebas recuperadas. En seis de 10 muestras (60 %) se encontraron protozoarios con un patrón morfológico compatible con formas ameboides y quísticas del género Naegleria. No se pudo demostrar la presencia del género Acanthamoeba. Este es el primer estudio que demuestra la presencia de amebas del género Naegleria en fuentes públicas en Colombia. No hubo una correlación directa entre el pH y la temperatura y la presencia estas amebas. La presencia del género Naegleria en aguas de fuentes públicas no indica que correspondan a especies patógenas para el ser humano.