Objetivo: Comparar los cambios clinicos y microbiologicos en pacientes de bajos recursos con periodontitis cronica con terapia manual sola y combinada con ultrasonido. Materiales y Metodos: Se diseno un estudio experimental. Se evaluaron 19 pacientes de la Facultad de Odontologia de la Universidad Cooperativa de Colombia - Pasto. Resultados: En la terapia manual, el nivel de insercion clinica ganado fue de 0.5mm (p< 0.05), se observaron CGn en 16% y BGn en un 25%. En la terapia combinada, la ganancia fue 1.4mm (p< 0.05), el nivel de insercion clinico fue 1.5mm, CGn en un 28% y BGn en un 57%. Conclusiones: En la terapia manual se observo disminucion en los niveles de insercion clinica; mientras en la combinada el sangrado gingival. Las dos terapias proporcionan disminucion de la flora subgingival. Sin embargo en la combinada existio mayor cantidad de CGn y BGn.