La ingenieria genetica de plantas es una herramienta del fitomejoramiento vegetal que puede acompanar los metodos de produccion convencional de variedades de interes. El desarrollo de una variedad transgenica requiere de un metodo de seleccion que permita distinguir los individuos transformados del conjunto de plantulas regeneradas en un medio de cultivo in vitro. Sistemas de seleccion alternativos a los que se basan en genes marcadores que confieren resistencia a antibioticos y herbicidas han sido desarrollados como respuesta a los riesgos potencialmente asociados de la introduccion de este tipo de secuencias en el genoma vegetal. Los estudios sobre la transferencia horizontal de genes entre plantas transgenicas y microorganismos y/o celulas del consumidor muestran que la probabilidad del evento es extremadamente baja. El flujo vertical de genes desde un cultivo transgenico a cultivos y/o especies silvestres relacionadas responde a las caracteristicas de la herencia mendeliana simple. La naturaleza del transgen, el cultivo donador y receptor, asi como la presion selectiva son los elementos que se tienen en cuenta en la implementacion de planes de manejo de riesgo que incluyen aislamiento por barreras geograficas, geneticas y reproductivas. Sistemas de seleccion basados en el uso de genes codificantes para enzimas que intervienen en el metabolismo vegetal de los azucares han sido propuestos para solucionar el problema tecnico de la baja frecuencia de transformacion y el problema de aceptacion del producto transgenico por parte del consumidor que afrontan los sistemas de seleccion convencionales. La permanencia del gen marcador de seleccion es innecesaria en el producto transgenico final una vez que se ha cumplido la etapa de seleccion. Por esta razon, sistemas de remocion se han desarrollado con el objetivo de eliminar estas secuencias especificas del genoma de la planta transformada. Sin embargo, requieren procedimientos complejos, que requieren alta inversion de tiempo, dinero y esfuerzo. La reaccion en cadena de la polimerasa (PCR) es una herramienta metodologica potencialmente ventajosa en la seleccion de plantas y en la produccion de individuos libres de genes marcadores de seleccion. La evidencia de la integracion del transgen por medio de PCR puede considerarse una propuesta viable en cuanto a implementacion practica, versatilidad y confiabilidad de la planta transgenica. El sistema de seleccion por PCR contribuye a la insercion competitiva de los cultivos transgenicos dentro del marco socio-economico con respecto a las variedades modificadas geneticamente producidas en la actualidad.