El Herpesvirus humano-6 (HVH-6) es un Betaherpesvirus aislado por primera vez en 1986 de pacientes VIH+, inmunodeprimidos y con trastornos linfoproliferativos. Se adquiere en edad temprana de la vida, generalmente antes de los 3 años, presentando seroprevalencia >95% en población adulta. Después de primoinfección se caracteriza por su latencia y se puede reactivar generando diferentes patologías. Las manifestaciones clínicas varían durante la primoinfección, reactivación o a las condiciones de inmunosupresión del paciente. Clínicamente, se asocia con manifestaciones neurológicas, dermatológicas y fatiga crónica, sobre las cuales no existen datos para el Departamento del Cauca. Este estudio evaluó la implementación de técnicas moleculares para diagnóstico (qPCR) de HVH-6 y otros métodos diagnósticos convencionales. Los resultados fueron analizados en conjunto con los hallazgos clínicos. Se incluyeron 48 participantes (30 Sospechosos y 18 No Sospechosos de HVH-6), 17 hombres y 31 mujeres con edad promedio 45 años (18-79), a quienes se les realizó qPCR para ADN de HVH-6, ELISA IgG específica para HVH-6 y Test de Tzanck con una positividad del 17%, 85% y 23% respectivamente. Las manifestaciones clínicas en los pacientes sospechosos de HVH-6 fueron clasificadas como: Generales (83%), con compromiso Neurológico (99%), de Fatiga Crónica (93%) y Dermatológicas (86%), datos generados por primera vez en el Departamento del Cauca. Si bien se observó una baja carga viral mediante la técnica molecular de qPCR, esta representa una herramienta diagnóstica que complementa y agrega especificidad a las técnicas convencionales de ELISA y Test de Tzanck para la identificación y detección de HVH-6.