La Gestión de la Propiedad Intelectual (GPI) es un tema de interés crítico en la actual sociedad del conocimiento. Para mejorar su gestión en proyectos de innovación abierta en la investigación científica entre Universidad-Empresa-Estado, es necesario conocer e implementar adecuadamente los procesos, estructura y políticas que la engloban. Este trabajo analiza la situación actual y los problemas existentes en los grupos de investigación de la Universidad de Antioquia con respecto a los procesos de Gestión de Propiedad Intelectual (GPI) implementados en los proyectos de (I+D) realizados en el marco de la innovación abierta. Debido a que en esta investigación se inquiere el fenómeno social desde la perspectiva propia del actor, tratando de develar lo que los entrevistados perciben como importante, se optó por el enfoque metodológico cualitativo y el uso de la técnica de análisis de contenido. En los resultados se identificaron la ausencia de políticas claras y la falta de visión estratégica en la planificación y control de los procesos claves de GPI (gestión de proyectos de I+D; vigilancia tecnológica; estrategias de protección; valoración tecnológica; transferencia y explotación de la tecnología; y control de la PI). Finalmente, se propone un modelo con unas recomendaciones tendientes a lograr la adecuada GPI en la Universidad, que favorezca la producción y explotación de activos de conocimiento en el marco de la innovación abierta.