Se propuso un modelo de simulacion dinamica para explicar el proceso de remocion de materia organica expresada como emergia y determinar la sustentabilidad en la planta de tratamiento (PTAR) El Salitre fase 1- Bogota D.C., Colombia a traves del tiempo, y se modelo el funcionamiento normal de la PTAR. Los modelos incluyen se basan principalmente en la DBO5 y su remocion como variable que determina el mayor flujo de emergia, modelacion que se baso en ecuaciones diferenciales y utilizo el metodo Euler de integracion con el programa computacional Vensim Ple. La metodologia de analisis de sustentabilidad, basada en el analisis de la emergia, se calculo a partir de los indices de apropiacion de la emergia (EYR), carga ambiental (ELR) y sustentabilidad de la emergia (ESI); la primera simulacion mostro que la planta presenta una baja sustentabilidad relacionada con la remocion de la materia organica, mostrando como esta variable incide en la evaluacion de la emergia. El modelo mostro tener, segun el analisis de sensibilidad de Montecarlo, una relacion de la variacion en los indices de sustentabilidad y remocion de contaminantes con respecto al caudal, validando asi el modelo y corroborando su aplicabilidad a este tipo de procesos. Esta herramienta permitira una mejor toma de decisiones de ajuste en los procesos y operaciones de las PTAR, asi como una formulacion de politicas gubernamentales que mejoren los procesos de tratamiento y el flujo de energia en las ciudades.