La frecuencia de micosis invasoras causadas por Candida sp en pacientes inmunocomprometidos o con tratamientos medico-quirurgicos ha aumentado y con ello, el uso de azoles, facilitando la aparicion de resistencia. Objetivo: Comparar tres metodos de deteccion de susceptibilidad in vitro a fluconazol: el metodo de referencia M27-A2 del CLSI (Clinical Laboratory Standard Institute), tecnica de difusion en disco a 90 aislados obtenidos en procesos infecciosos invasores (49 C. albicans; 30 C. tropicalis; 5 C. parapsilosis; 4 C. guilliermondii y 2 C. lusitaniae) y la epsilometria (E-test®) en 16 aislados. Resultados: La susceptibilidad fue mayor a 90%. Se encontro un buen porcentaje de concordancia entre las tecnicas de difusion de disco y E-test® con respecto al metodo de referencia (0,944 y 0,938, respectivamente). Conclusion: En nuestra institucion se considera de eleccion fluconazol para tratar infecciones micoticas invasoras y recomendamos las tecnica de difusion en disco o E-test® para determinar la susceptibilidad en la rutina en hospitales de alta complejidad en Colombia.