La innovacion es un elemento caracteristico del crecimiento regional sobre el cual las universidades, a traves de su funcion de investigacion, fungen como pilares garantes para su desarrollo. Por ello, esta investigacion procuro un analisis prospectivo de los agentes que impulsan la capacidad innovativa en unidades universitarias de investigacion agropecuaria fundamentado en los postulados de Bueno, et al. (2011) y Riera & Paez (2009), a traves de una Matriz de Impactos Cruzados por Multiplicacion Aplicada a una Clasificacion (MICMAC). Se concluye que el rubro aprendizaje y capacitacion del talento humano es el que anade mayores niveles de motricidad a la capacidad innovativa de las unidades estudiadas. Asimismo, la mitad de las variables que integran este rubro se consideran claves e influyentes de manera directa e indirecta sobre la mayoria de las variables que integran el diseno organizativo, especialmente en lo relacionado a la innovacion del modelo organizacional.