Este trabajo tiene como intencion mejorar el proceso de ensenanza – aprendizaje del concepto de celula en estudiantes del grado sexto de bachillerato de la institucion educativa Leonardo Da Vinci de la ciudad de Manizales, a traves del diseno de una unidad didactica; pues estas permiten la integracion de los componentes conceptuales y metodologicos necesarios para lograr aprendizajes profundos, al tener en cuenta aspectos como ideas previas, representaciones, historia y epistemologia del concepto de celula, el lenguaje, la metacognicion y la motivacion en el diseno de la unidad. Para esto, se parte de la aplicacion de un cuestionario de 18 preguntas, el cual explora las ideas previas, a partir de las cuales se identifican los diferentes modelos explicativos que tienen los estudiantes para dar cuenta del concepto de celula, tambien, se determinan los obstaculos mas frecuentes frente al aprendizaje del mismo, todo esto para orientar el diseno de la unidad didactica. La investigacion aporta una herramienta didactica al docente de ciencias para reflexionar sobre su ensenanza y una herramienta a los estudiantes que les permitira solucionar problemas cotidianos en diferentes contextos.