La salud animal cobra importancia cuando en los procesos productivos se generan impactos en costos y en el riesgo de infecciones zoonoticas, lo cual, sin embargo, puede mitigarse con varias estrategias. Una es el estudio de mejores metodos diagnosticos para la vigilancia y el control de enfermedades, que esta emergiendo como una prioridad en enfermedades como la anaplasmosis y la babesiosis. En el transcurso de los ultimos anos se han observado perdidas economicas que rondan los billones de pesos anuales y que en paises de baja produccion impactan de manera negativa en los pequenos productores. El diagnostico temprano y la investigacion de potenciales biomarcadores mediante la aplicacion de herramientas moleculares son estrategias que deben integrarse en el estudio actual de estas enfermedades, de manera que las decisiones frente a la emergencia de perfiles epidemiologicos favorezcan la oportuna intervencion y el control de la enfermedad de transmision vectorial. El proposito de esta revision es conocer los avances en el estudio de la babesiosis y la anaplasmosis relacionados con su impacto y con la exploracion de marcadores moleculares.