A nivel mundial, segun la WHO y la UNICEF para el 2015 cerca de 844 millones de personas no tenian acceso a ningun servicio basico del agua. Adicionalmente, tambien se estima que mas 2 billones de personas, la mayoria habitantes de zonas rurales, no tienen servicios de agua potable gestionados de forma segura. En el caso de las zonas rurales de Colombia, cerca del 40% presento riesgo alto de calidad del agua. Lo anterior se debe en parte, como se describe en esta investigacion, por la implementacion no sostenible de alternativas no adecuadas, con poco conocimiento de las zonas rurales y la falta de participacion de las comunidades. Por lo tanto, es necesario que el proceso de toma de decision se observe desde un contexto local, se incluya la participacion comunitaria y tenga un enfoque holistico para garantizar la sostenibilidad del servicio del agua rural. Esta tesis de investigacion propone el desarrollo de una metodologia de priorizacion y diferenciacion que permita identificar la mejor alternativa sostenible de proyectos de aprovisionamiento de agua en una zona rural colombiana. Para el caso de estudio, la aplicacion de la metodologia propuesta se realiza en comunidades indigenas de la Quebrada Yahuarcaca en el Amazonas colombiano: San Pedro, San Juan, San Antonio y San Sebastian. Primero, desde una mirada local, se establece la contextualizacion de la zona de la estudio, luego se escoge el marco de la sostenibilidad que resulta ser particular en cada caso y posteriormente se realiza la caracterizacion de la zona con herramientas cualitativas y cuantitativas, donde la comunidad participa en la toma de decisiones a traves de talleres de cartografia social. Despues, se procede a disenar los objetivos; seleccionar los criterios e indicadores mas estrategicos con un enfoque holistico; seleccionar las alternativas mas acordes al contexto rural; y aplicar el modelo ANP para la priorizacion de la alternativa. Para dar aplicacion a la priorizacion, se selecciono a la comunidad de San Juan. Los indicadores con mayor puntaje fueron la aceptacion social del proyecto y la facilidad a la participacion local debido a la fuerte asignacion al peso del criterio social como lo establecia el marco de sostenibilidad. Mientras tanto, de las cinco alternativas tecnologicas propuestas, el mayor puntaje lo obtuvo la planta compacta de potabilizacion por encima del proyecto de post-construccion ya implementado en la zona de estudio. Finalmente, con el analisis de sensibilidad se cambiaron las asignaciones de pesos a nivel de cluster, demostrando la robustez y la sostenibilidad de la planta compacta en los criterios ambientales y tecnologicos.