Esta investigacion identifico la influencia que tiene la calidad del agua del arroyo Leon sobre la cienaga de Mallorquin. Para el estudio del arroyo Leon se utilizo el “sistema de Indicadores Hidricos, por intervencion Antropica” llamado Indice de Calidad de Agua (ICA) y senala el grado de calidad de un cuerpo de agua en terminos del bienestar humano independiente de su uso, en un tiempo determinado (IDEAM, 2005). Para la cienaga de Mallorquin se aplico el indicador ICAM (Indice de Calidad Marina), el cual facilita la interpretacion de la calidad del ambiente marino, la evaluacion del impacto de las actividades antropogenicas y valorar la calidad de las aguas marinas (INVEMAR 2007). Se seleccionaron 13 puntos de muestreos en el cauce del arroyo Leon y 10 en la Cienaga de Mallorquin, se consideraron 7 parametros, entre fisicoquimicos y microbiologicos. El muestreo se realizo en dos epocas: una invernal, junio-agosto 2018 y una seca octubre 2018 - marzo 2019. Para la evaluacion normativa se tuvo en cuenta la normativa ambiental, decreto 1076/2015, y Resolucion 258/2011 de la Corporacion Autonoma Regional del Atlantico. Los resultados indican que el arroyo, desde su origen y hasta la desembocadura presenta un ICA catalogado como “MALA”, la cienaga de Mallorquin, presenta una calidad del agua “Pesima”, indicador del mal estado del cuerpo marino. En zona donde desemboca el arroyo Leon sobre la cienaga se observan los valores mas bajos en las escalas ICA e ICAM, evidenciando la afectacion que tiene el arroyo sobre la cienaga.