Se evaluo la calidad ecologica del agua en el rio Melendez en su cuenca media y baja a traves de la aplicacion de indices de calidad y contaminacion en el ecosistema acuatico usando mediciones de parametros fisicoquimicos y su asociacion con la presencia de algunos macro invertebrados acuaticos. En adicion se evaluo un escenario de control en las descargas de aguas residuales domesticas con mayor carga contaminante usando el modelo simplificado de Oxigeno Disuelto propuesto por Streeter Phelps. Este estudio fue realizado en un dia lluvioso en el ultimo cuarto del ano 2016 con el objetivo de encontrar el estado ecologico del rio en tiempos de alta pluviosidad para evaluar la pre factibilidad en el uso de este tipo de estudios en futuros proyectos de restauracion ambiental en la ciudad; en general los indices de calidad ecologica muestran una alteracion considerable en el bosque de ribera de la cuenca media y una degradacion extrema en su parte baja. Por otra parte, los resultados de los parametros fisicoquimicos medidos muestran niveles altos de Oxigeno Disuelto (7.21 mg/L en la cuenca media y 6.63 mg/L en la cuenca baja), pH muy cercano a la neutralidad en todas las estaciones medidas. DBO5 y DQO con valores que no exceden los 12 mg/L, mientras que los niveles de coliformes fecales presentan niveles elevados de presencia de individuos en la cuenca baja (hasta 66000 UFC) mostrando un cierto grado de contaminacion en este tramo final del rio. En cuanto a los indices hidrobiologicos se encontraron un total de 7 familias diferentes de macro invertebrados haciendo uso de los metodos de captura manual con redes, de acuerdo con estos resultados el indice BMWP-Col muestra que el rio presenta aguas muy contaminadas debido a la descarga de aguas residuales domesticas en su cauce. Los parametros fisicoquimicos medidos y las especies de macro-invertebrados encontradas presentan una buena correlacion de acuerdo con el analisis estadistico de correspondencia canonica mostrando asociaciones fuertes en el eje X con el pH (correspondencia de 0.904) y OD (correspondencia de 0.919), por otra parte, en el eje Y se encontro una fuerte correlacion con la DBO (correlacion de 0.819). Este proyecto contribuye en la exploracion de nuevos metodos de analisis en la calidad de nuestros recursos hidricos y en como las autoridades ambientales colombianas pueden complementar sus estudios haciendo uso de los indices ecologicos de manera mas frecuente tanto espacial como temporal