El presente estudio se llevo a cabo en el Centro Control Contaminacion del Pacifico ubicado en la ciudad de Tumaco en el departamento de Narino, este centro es una dependencia directa de la Direccion General Maritima Nacional; en el se realizan investigaciones tendientes a dar solucion a problemas del ecosistema marino en el Pacifico Colombiano. El presente estudio pretendio intervenir en un problema ambiental presentado en las aguas de la Bahia de Tumaco por la contaminacion con hidrocarburos, suministrando como tratamiento biologico, un consorcio nativo capaz de degradar el contaminante. En este trabajo se aislaron e identificaron cepas nativas con potencial biodegradador como, Bacillus subtilis (33,3%), Bacillus cereus (22,2%), Staphylococcus sp. (22,2%), Micrococcus sp. (11,1%), Acinetobacter iwoffii (11,1%) Bacillus anthracis (11,1%).Las cepas Bacillus cereus, Staphylococcus sp., Micrococcus sp., Bacillus subtilis, Bacillus anthracis presentaron los mejores porcentajes de remocion de hidrocarburos y se seleccionaron para la formacion del consorcio microbiano, obteniendo un porcentaje de biorremediacion de 82.7% de las aguas contaminadas con hidrocarburos de la Bahia de Tumaco. La biodegradacion se vio afectada por factores fisicos y ambientales, como: temperatura, pH, aireacion, turbulencia, concentracion de nutrientes. Se obtuvo un buen crecimiento del consorcio, alcanzandose un valor en la concentracion de hidrocarburo menor al inicial, concluyendose la eficiencia y eficacia del consorcio microbiano nativo aislado de las aguas de la Bahia de Tumaco.