Esta investigacion se realizo en la Granja Experimental Botana ubicado en el municipio de Pasto, Departamento de Narino, para evaluar algunas variables agronomicas del cultivo de lechuga (Lactuca sativa L.) en un sistema acuaponico de recirculacion en condiciones de invernadero. Dentro del estudio se evaluaron los sustratos cascarilla de arroz, turba y grava en el sistema acuaponico con tres tratamientos y un testigo NFT (solucion de Hoagland) utilizada principalmente para la nutricion de cultivos hidroponicos, esta solucion esta constituida por macro y micronutrientes esenciales para la produccion de plantas. El sistema se construyo con tubos de PVC de 4” por tres metros de largo ubicados sobre una estructura metalica y 144 plantas por modulo para un total de 504 plantas de las cuales se tomo una muestra representativa de la poblacion para la evaluacion. Se realizo un analisis nutricional para elementos menores y fosforo utilizando la metodologia propuesta por Salinas y Garcia, de igual forma se realizo un analisis de aguas para conocer la cantidad de nitratos presentes en el agua y el nivel de biorremediacion realizado por las plantas. El diseno estadistico fue de bloques completos al azar con tres repeticiones y cuatro tratamientos por modulo. Como analisis de costos se hizo una tasa interna de retorno con todos los gastos generados durante la investigacion. El sistema acuaponico de recirculacion con sustratos obtuvo valores adecuados de nutrientes para el crecimiento y desarrollo normal del cultivo mediante el proceso de biorremediacion demostrando ser una alternativa amigable con el medio ambiente.