Chromolaena tacotana es una especie que se encuentra ampliamente distribuida en Colombia, se caracteriza por su contenido de flavonoides de los cuales poco se conoce sobre su actividad anticancerígena. En esta investigación se evaluó la actividad citotóxica y genotóxica de cuatro flavonoides presentes en las hojas de Chromolaena tacotana previamente aislados por el grupo de investigación PRONAUDCA: 5,3´-dihidroxi-7,4-dimetoxiflavonol (F1), 3´,4´-dihidroxi-5,7-dimetoxiflavanona (F2), 4´-hidroxi-5,7-dimetoxiflavanona (F3) y 4-hidroxi-5,7-dimetoxiflavononol (F4) sobre líneas celulares cancerosas PC3 y MDA-MB-231 y la línea celular sana MRC5. Mediante el ensayo MTT se evaluó la actividad antiproliferativa y por medio de microscopia de fluorescencia se determinó los efectos de los flavonoides sobre la morfología de las células, finalmente con el ensayo cometa se evaluó el daño al ADN. Todos los flavonoides presentaron actividad antiproliferativa sobre las líneas celulares de cáncer, sin embargo, F2 y F3 muestran los mayores efectos antiproliferativos, citotóxicos y genotóxicos sobre PC3 y MDA-MB-231.