Cada semestre entre 2006-2008 se realizo un muestreo de cetaceos en la Cuenca Pacifica Colombiana (CPC), utilizando como plataforma de observacion los buques de la Direccion General Maritima (Dimar) que realizan los cruceros oceanograficos Pacifico-ERFEN. El metodo empleado fue el de transecto lineal. Los muestreos fueron realizados durante los dos periodos estacionales climaticos y oceanograficos identificados en la Cuenca. Se evaluo la riqueza, la diversidad, la distribucion y la abundancia relativa espacial y estacional. Para relacionar la variabilidad oceanografica y los patrones de ocurrencia de la comunidad de cetaceos se utilizo una ordenacion de Escalamiento Multidimensional No-metrico (NMS) donde las unidades de muestreo fueron cuadrantes de un grado de latitud por uno de longitud. Se ajusto una funcion de deteccion de distancias perpendiculares para pequenos y grandes cetaceos. El esfuerzo visual fue de 7706.8 km, en condiciones del mar con valores de la escala de Beaufort entre cero y tres. Se registro un total de 217 grupos de los cuales el 74% se identifico hasta el nivel de especie. La mayoria de los grupos de cetaceos se observaron en aguas oceanicas, y las zonas que presentaron las mayores ocurrencias por unidad de esfuerzo durante el primer semestre fueron Cabo Marzo y el Suroeste de Isla Malpelo. Solo cuatro especies de las 14 identificadas se encontraron en aguas costeras, entre las que se encuentra el delfin listado (Stenella coeruleoalba). Esta especie fue la mas abundante durante el primer semestre, seguida por el delfin moteado (S. attenuata) y el delfin nariz de botella (Tursiops truncatus). Durante el segundo semestre la especie mas abundante fue la ballena jorobada (Megaptera novaeangliae) seguida por el delfin listado y el delfin nariz de botella. Al dividir la CPC en 29 cuadrantes de un grado de latitud por uno de longitud, se encontraron diferencias significativas de la abundancia relativa y la riqueza entre las dos epocas climaticas del ano, a pesar de las grandes diferencias oceanograficas interanuales ocasionadas por eventos como El Nino y La Nina. La menor riqueza y abundancia relativa del segundo semestre en la CPC estaria influenciada por las migraciones regionales reportadas en el Pacifico Oriental Tropical que hacen que durante este periodo las especies se desplacen hacia la Contracorriente Ecuatorial del Norte, y por condiciones locales que restringen su presencia. En contraste con el primer semestre, durante el segundo semestre la CPC presenta una termoclina debil y profunda, menor concentracion de clorofila en superficie y menor probabilidad de frentes, caracteristicas que probablemente inciden en la disponibilidad de presas. En la ordenacion NMS, el primer eje estuvo correlacionado con la Temperatura Superficial del Mar (TSM) durante el 2006 y el 2007. En el primer ano, el delfin comun (Delphinus delphis) se asocio con aguas con mayor TSM. Durante el 2007, el delfin moteado se asocio con aguas calidas, mientras que el delfin de diente rugoso (Steno bredanensis) y el delfin listado se asociaron con aguas mas frias. Durante el 2008 las variables no se asociaron con ningun eje, pero se observaron gradientes en las ocurrencias que pueden estar influenciados por otras variables no evaluadas. Las variables descriptoras de la columna de agua se asociaron con el segundo eje marcando un patron estacional, pero solo durante el 2006. Se sugiere continuar el muestreo desde las plataformas de oportunidad de Dimar y se dan varias recomendaciones para mejorar el muestreo.