Se obtuvieron diez aceites esenciales de diferente material vegetal de pimpinella anisum (anis - semilla), citrus sinensis (naranja - cascara), aloysia citriodora (cidron), ruta graveolens (ruda), mentha pulegium (poleo), citrus reticulata (mandarina - cascara), foeniculum vulgare (hinojo), cymbopogon citratus (limonaria), eucalyptus globulus (eucalipto) y romarinus officinalis (romero) empleando el metodo de hidrodestilacion asistida por microondas, con rendimiento que oscilan entre 1,5% y 0,007%. Se evaluo la actividad antimicrobiana de los aceites esenciales mediante el metodo de microdilucion en placa frente a los microorganismos escherichia coli, salmonella typhi y candida albicans, dando como resultado que el AE de limonaria fue el que presento mejor actividad frente a E. coli (CIM: 2000-1000 μg/mL, CBM: 2000-1000 μg/mL) y frente a C. albicans (CIM:500-250μg/mL, CFM: 500-250μg/mL). Adicionalmente se evaluo la citotoxicidad de los aceites, de los cuales el aceite de eucalipto fue uno de los que menos presento citotoxicidad con CC50 > 3000μg/mL frente a Celulas Vero y J774.