La nutria gigante Pteronura brasiliensis es uno de los mayores depredadores de los sistemas acuaticos de la Orinoquia colombiana. En Colombia mantiene la categoria “En peligro” de la IUCN y actualmente la principal amenaza que enfrenta es la degradacion de su habitat. Se realizaron recorridos a pie por orillas de lagunas y canos y recorridos en bote en el cauce principal de segmentos de los rios Bita y Orinoco. En puntos de muestreo de orilla sistematicamente elegidos, que corresponden a puntos con ausencia de rastro; y en cada punto donde se encontraron campamentos o madrigueras, se midieron variables del microhabitat que caracterizan la estructura fisica y la vegetacion de la orilla. A partir de indices de abundancia de madrigueras y campamentos y mediante analisis de contingencia para tablas R X C se determinaron uso y preferencias de habitat y microhabitat de la nutria gigante. Se encontro una preferencia por canos y lagunas para la construccion de madrigueras y campamentos. Se observo que la zona de ventanas caracterizada por afloramientos rocosos dentro del rio Orinoco es habitat para nutrias gigantes aunque es atipico segun lo registrado en su area de distribucion. Madrigueras y campamentos estan asociados a orillas con grandes arboles caidos, suelos organicos y en menor proporcion con sustratos rocosos. En particular las madrigueras estan asociadas con sistemas de raices y barrancos medianos. Es importante la proteccion de los sistemas acuaticos de esta zona en especial de lagunas, canos y de la zona de ventanas dentro del rio Orinoco. El cuidado de las orillas es fundamental para asegurar la permanencia de poblaciones locales de la especie. El estudio reitera la importancia de realizar programas de investigacion a largo plazo para profundizar en el conocimiento ecologico de la especie y generar estrategias de manejo y de conservacion de los ecosistemas acuaticos en la region.