Los polihidroxialcanoatos (PHAs) se acumulan en diferentes especies bacterianas y tienen potencial para reemplazar los plasticos de origen petroquimico con la ventaja que son biodegradables. Sin embargo, sus aplicaciones son limitadas por los costos de produccion; por ello, se han implementado diferentes estrategias como la obtencion de estos biopolimeros a partir de sustancias de desecho. En este sentido, se evaluo la sintesis de PHAs como una estrategia para disminuir la carga organica acumulada en las aguas residuales que se descargan al rio Pasto. Para esto, se tomaron muestras de agua de cinco estaciones ubicadas en el cauce principal del rio Pasto. Despues, mediante la tecnica de diluciones seriadas y siembra por superficie en placas de agar plate count suplementado con glucosa y Nilo azul A, se obtuvieron 44 aislados que presentaban fluorescencia naranja cuando se observaron a luz ultravioleta. Posteriormente, empleando tecnicas analiticas se establecio que el aislamiento E1M10 RP produce hasta 5,24 gL-1 de polihidroxibutirato en un medio sin optimizar con glucosa como fuente de carbono. Despues, mediante el analisis de la secuencia parcial del gen 16S rRNA el aislado E1M10 RP tuvo 96% de identidad con Bacillus subtilis. Finalmente, en bioreactores de flujo ascendente operados bajo un sistema de fermentacion continua con un volumen de trabajo de 2L, se determino el efecto de factores nutricionales y operacionales sobre la remocion de materia organica de las aguas residuales vertidas al rio Pasto utilizando como inoculo adicional esta bacteria. Los resultados obtenidos con estas metodologias permitieron establecer que la remocion de la materia organica fue del 94,63% y que los factores nutricionales KCl, Na2SO4, ZnCl2 y el factor operacional VVM inciden significativamente en el proceso. Adicionalmente, como subproducto del tratamiento se recupero hasta 0,111gL-1 de polihidroxibutirato. Por lo tanto, es posible tratar las aguas residuales de la ciudad de Pasto con bacterias silvestres productoras de PHAs.