En los ultimos anos, la separaci6n por la tecnica de electroforesis de las enzimas que presentan polimorfismo, ha sido utilizada para establecer diferencias entre poblaciones de microorganismos, cuando las caracteristicas morfologicas no son distintivas. En este trabajo, se propuso la separacion por electroforesis de la enzima aril esterasa obtenida a partir de aislamientos de Fusarium oxysporum f. sp. dianthi de la raza 2 obtenidos de suelos y plantas de la Sabana de Bogota, un aislamiento de la misma forma especial y raza procedente de Italia, aislamientos de las razas 1, 4 y 8 de Fusarium oxysporum f. sp. dianthi, un aislamiento de Fusarium oxysporum f. sp. Lycopersici, aislamientos de Fusarium oxysporum no patogenicos y un aislamiento de Phialophora cinerescens. Los resultados muestran que mediante la separacion electroforetica de aril esterasa es posible determinar diferencias entre poblaciones del genera Fusarium. Palabras claves: Enzimas, Electroforesis. Polimorfismo, Fusarium, Aril esterasa.