Introduccion: Los parasitos intestinales tienen alto impacto en la salud de la poblacion mundial y pueden constituir un factor mas de riesgo en poblaciones en alto grado de vulnerabilidad por desplazamientos humanos a causa de la pobreza, violencia o catastrofes naturales. Objetivo: Evaluar el parasitismo intestinal en los habitantes de dos asentamientos humanos en alto grado de vulnerabilidad. Metodos: estudio descriptivo de corte transversal, en el que se analizaron 367 muestras fecales de los habitantes de dos asentamientos humanos en estado de vulnerabilidad del departamento del Atlantico-Colombia, durante los anos 2015 y 2016. Se realizo examen directo de las heces en solucion salina, lugol y concentracion con el metodo formol-eter. Se establecio la frecuencia absoluta y relativa de los parasitos presentes y se compararon los resultados entre los dos lugares de muestreo. Resultados: el 91,28 % de la poblacion analizada tenia parasitos intestinales. Las helmintiasis presentaron una frecuencia del 52,32 %. Los parasitos mas frecuentes fueron Blastocystis sp. (49,05 %) y Trichuris trichiura (44,96 %). Conclusiones: La alta prevalencia de parasitos en las poblaciones vulnerables analizadas, plantea la necesidad de implementar estrategias para el control del parasitismo intestinal dentro de los planes de prevencion y mitigacion de riesgos.