Introduccion: El cancer es una enfermedad con unimportante numero de casos en Colombia, evidenciados enlos registros de cancer poblacional que permiten detallarsu aparicion y asociarlo a multiples variables, entre ellas,su localizacion anatomica. Objetivo: Establecer el primerregistro de cancer institucional en el departamentodel Cauca, y describir la frecuencia del cancer en dos centros de referencia: el Hospital Universitario San Jose (HUSJ) y la Compania de Patologos del Cauca (CPC). Metodos: Se llevo a cabo un registro institucional con censo entre enero y diciembre del 2011. Se incluyeron resultados de 1.144 biopsias de pacientes que asistieron a dos centros de referencia del municipio de Popayan y que cumplieron los criterios de inclusion definidos. Se describieron las frecuencias de acuerdo al tipo de cancer y su distribucionpor genero y localizacion anatomica. Resultados: La mayoria de los pacientes documentados se encontraba entre los 15 y 39 anos. En toda la serie, los tumores mas frecuentes fueron: cervix 23.8%, piel no melanoma 14.1%, estomago 13.2%, mama 9.5% y prostata 6.3%. Los mas habituales por genero fueron: en hombres, cancer de estomago (24.8%), piel no melanoma (18.6%) y prostata (17.1%); y en mujeres, cancer de cervix (37.6%), mama (15.1%) y piel no melanoma (11.5%). Conclusion: El registro de cancer ayuda a establecer la distribucion anatomica de los tipos de cancer en una poblacion determinada. En este trabajo se evidencio que los tumores mas frecuentes fueron en las mujeres, cervix y piel no melanoma, y en los hombres el cancer de estomago.