El estudio del protestantismo que llego a America en el Siglo XVII debe partir del analisis de los criterios que impuso la Inquisicion Espanola para juzgar a los cristianos no catolicos en su condicion de herejes, en un momento historico en que las monarquias protestantes representaron para Espana el enemigo religioso, politico y economico; extendiendo a America la enemistad que se agudizo en el continente europeo. La Inquisicion, con respecto a las Indias, incluyo en sus estatutos y en sus manuales de procedimiento una casuistica local, y fundamentandose en ella fue emitiendo instrucciones particulares segun el territorio y la epoca en los cuales debieron aplicarse. Todo lo cual demuestra la flexibilidad del Santo Oficio en adaptarse a las circunstancias de tiempo y lugar y justifica la larga vida de la institucion.