El cancro del eucalipto causado por Chrysoporthe cubensis es una de las enfermedades mas limitantes para las plantaciones de Eucalyptus en la region tropical. Con el objeto de confirmar el hongo causal del cancer observado en plantaciones comerciales de E. pellita en la Orinoquia Colombiana y explorar la posible diferencia en susceptibilidad de algunos clones comerciales de la region, se aislo el patogeno a partir de tejido enfermo de arboles adultos y las cepas obtenidas se inocularon en plantas jovenes pertenecientes a diez clones, incluido un testigo de E. urophylla en condiciones de invernadero. Se comparo la longitud promedio de la herida desarrollada durante 53 dias despues de la inoculacion, con dos aislamientos del patogeno. Tambien se estimo la prevalencia del cancro en una plantacion de E. pellita de 7 anos de edad. Con base en los sintomas, y a caracteres morfologicos macro y microscopicos, los aislamientos se identificaron como Chrysoporthe cubensis y con el uso de los marcadores moleculares ITS5 e ITS4 como C. cubensis y C. doradensis. Todos los clones evaluados evidenciaron susceptibilidad al ataque de Chrysoporthe . Aun cuando el cancer del eucalipto es una enfermedad comun, constituye el primer registro de C. cubensis y C. dorandesis en plantaciones de E. pellita en la Orinoquia Colombiana. Dadas las condiciones favorables para el desarrollo de la enfermedad en la region, se recomienda continuar los esfuerzos de seleccion y evaluacion para contar con material tolerante a la enfermedad.