Objetivo: Describir mediante histopatologia los patrones neumonicos en cuyes (Cavia porcellus) de la mortalidad presentada en 30 dias en la Granja Experimental Botana de la Universidad de Narino. Metodos: se realizo un estudio longitudinal de tipo descriptivo. Se analizaron 70 casos correspondientes a la mortalidad presentada en la Granja Experimental Botana de la Universidad de Narino en el periodo del 14 de noviembre al 14 de diciembre de 2012, para ello se utilizaron los micro-preparados histologicos de hematoxilina y eosina correspondientes a la casuistica del laboratorio de patologia veterinaria de la Universidad de Narino. Se realizo una descripcion histopatologica de los patrones neumonicos segun grado de severidad, patron de distribucion, tipo de infiltrado celular, cronicidad, presencia de tejido no funcional y via de entrada. Resultados: La neumonia intersticial fue el hallazgo mas comun con un 48.6%, siendo la de tipo moderada la mas presentada tanto en machos (32.26%), hembras (28.95%), adultos (22.22%) y gazapos (32.56%). El 2.9% de las muestras fueron aparentemente normales. El grado de severidad de las lesiones moderada fue el hallazgo mas comun encontrado con un 35.7% de la poblacion, las lesiones severas se presentaron en el 30%. Lo anterior indica que el 65.7% de los cuyes probablemente presentaron sintomatologia clinica a la hora de la muerte. El patron de distribucion y el infiltrado inflamatorio fue predominantemente mononuclear en espacio intersticial con un 45.71%. Las alteraciones cronicas fueron predominantes en un 68.5% de la poblacion. Se encontro moderada hiperplasia del epitelio de vias respiratorias la cual fue mas frecuente con un 25.7% y en un 8.57% se presentaron sincitios. El 58.56 % de los casos indicaron la participacion directa o indirectamente de la via aerogena como via de entrada En la poblacion en general, la etiologia infecciosa en pulmon fue la mas comun (54.27%). En gazapos la etiologia viral en pulmon fue la mas comun (20.93%) y en adultos la etiologia bacteriana en pulmon fue la mas presentada (22.22%). La etiologia primaria distante a pulmon se presento en el 14.82%, de los animales adultos, esto es indicativo de que la causa de muerte de los animales objeto de estudio no esta directamente relacionada con enfermedad respiratoria. Conclusiones: Los resultados indican que los cuyes objeto de estudio son animales con enfermedades respiratorias de curso largo, con impacto negativo en su potencial productivo. Se recomienda hacer el diagnostico de afecciones respiratorias mediante metodos directos e indirectos (Serologia, PCR). Los resultados del trabajo permiten sugerir una propuesta para el diagnostico y clasificacion de neumonias en cuyes en explotaciones comerciales de la zona y puede ser utilizada para la clasificacion de neumonias en el area de catedra y servicio de patologia veterinaria de la Universidad de Narino