El proyecto de Ecoescuelas tiene como objetivo contribuir con contenidos conceptuales, procedimentales y actitudinales que aporten para la identificación y análisis de las problemáticas ambientales de las instituciones educativas seleccionadas, así como en la reorientación del Proyecto Educativo Institucional (PEI) y del Proyecto Ambiental Escolar (PRAE). El proceso de formación en las instituciones educativas intervenidas permite la reflexión de la comunidad académica y el diseño de matrices de transversalización con la problemática ambiental priorizada (como se verá más adelante), las cuales son evaluadas por los docentes con la intención de incorporarlas en los documentos institucionales y articularlas con la alternativa ambiental de solución que se construye en cada una de las instituciones educativas, fomentando así el fortalecimiento o reconstrucción de los Proyectos Ambientales Escolares, como estrategia de ambientalización curricular.