Objetivo: Determinar cuales son las diferencias teoricas y practicas en materia probatoria entre la competencia civil y contencioso administrativa en el desarrollo de los procesos de responsabilidad medica, segun la jurisprudencia de la Corte Suprema de Justicia y del Consejo de Estado. Metodologia: Este es un estudio de hermeneutica juridica que acude a los documentos jurisprudenciales y doctrinales como su base de analisis. Resultados: se encuentran diferencias sustanciales entre la Corte y el Consejo que dificultan la posibilidad de adelantar y dirimir conflictos en materia de responsabilidad medica, especialmente en lo que se refiere a la carga probatoria. Ademas, se destaca una diferencia considerable frente a la historia clinica como prueba en los asuntos galenicos llevados por ambas jurisdicciones.