En esta investigacion se aislaron microorganismos de un consorcio microbiano, presentes en humedales construidos a escala piloto de flujo sub-superficial horizontal, empleados en el tratamiento de aguas residuales de una industria textil. Los humedales estaban plantados con Phragmites australis y se monitorearon parametros fisicoquimicos como DQO, DBO5, ST, SST, SDT, nitratos, fosforo total y metales (hierro, manganeso, zinc, cobre, plomo). Los consorcios microbianos presentes en los humedales fueron aislados por tecnica de enriquecimiento selectivo a partir de una mezcla de cuatro colorantes y el consorcio que presento una mayor degradacion de color en el laboratorio fue elegido para su identificacion por metodos moleculares. Del aislamiento microbiano, se realizo la evaluacion de 24 consorcios, en los cuales se encontraron tasas de decoloracion de mas del 50%, el consorcio que mejor resultados arrojo estaba conformado por hongos y una bacteria (Rhodotorula mucilaginosa, Galactomyces pseudocandidum, Rhodotorula sp. y Escherichia coli). En promedio se presentaron remociones mayores del 50% de DQO y del 80% de DBO5. De los cinco metales estudiados solo se encontraron trazas de manganeso y plomo