El CO2 es un gas de efecto invernadero resultado de actividades antropicas o procesos biologicos que influye en el aumento de la temperatura global. Los ecosistemas son fuente o reservorio de CO2 y son alterados por cambios climaticos. En ese sentido, los sistemas agroforestales (SAF) fijan el CO2 en carbono organico almacenado en suelo, necromasa, y productos forestales. El suelo es el mayor sumidero terrestre de carbono organico por lo que se hace necesario investigar sistematicamente el efecto del dosel de sombra en el suelo de los sistemas agroforestales, debido a su aporte de microclimas, materia organica y barreras contra procesos erosivos del suelo, generando una dinamica de almacenamiento de carbono y de reduccion en la respiracion de suelo que pueden promover la adaptacion y la mitigacion del cambio climatico. En Tibacuy, Cundinamarca se evaluo el efecto del dosel de sombra en el almacenamiento de carbono organico en suelos y la respiracion se suelo de sistemas agroforestales cafeteros de Sombra alta (SA), Sombra media (SM) y Sombra baja (SB). Se seleccionaron 5 fincas por cada tipologia de sombra realizando analisis fotografico de apertura del dosel y de radiacion transmitida con el software GLA® (Gap Light Analyzer), las fincas seleccionadas contaron con plantaciones de cafe variedad Castillo en edad productiva entre 4 a 8 anos. En cada finca se establecio una parcela de 1000 m2 en donde se estimo la respiracion de suelo, el carbono almacenado en hojarasca y carbono organico de suelo COS. Se uso camara SRC-1 de CIRAS3 para medir la respiracion del suelo durante tres meses, en tres horas del dia: 9:30am, 12:30m y 03:30pm; Se colecto hojarasca en entrecalles y bajo plantas de cafe; Se usaron transectos de linea perpendiculares para medir longitudes, diametros y durezas de la Madera muerta caida (MMC) interceptada por la linea; Metodo de cubicacion y factor de expansion de biomasa para estimar el carbono de la madera muerta en pie (MMP); se uso metodo de volumen conocido para densidad aparente y Walkey black para carbono organico de suelo (COS); por ultimo se tomaron las condiciones climaticas del municipio para analizarlas con la respiracion de suelo. Como resultado, el carbono organico total almacenado en los sistemas con diferente nivel de sombrio, presento alta proporcion en COS, seguido de hojarasca, MMC y MMP (137,7; 3,7, 3,01 y 0,95 t C/ha, respectivamente). El carbono en hojarasca presento diferencias altamente significativas (p<0,0001), con mayor almacenamiento en el sistema SA seguido de SB y SM (4,3, 3,7 y 3,2 t C/ha, respectivamente). El carbono en MMP presento diferencias significativas (p=0,0003) con mayor almacenamiento en el sistema SM seguido de SA y SB (1,2, 1,0 y 0,7 t C/ha, respectivamente). Carbono en MMC presento diferencias altamente significativas (p<0,0001) con mayor almacenamiento en el sistema SB seguido de SA y SM (4,8, 2,3 y 1,9 t C/ha, respectivamente). El carbono organico de suelo con diferencias altamente significativas (p<0,0001), presento mayor almacenamiento en el sistema SM, seguido de SA y SB (182,1, 121,0 y 109,9 t C/ha, respectivamente). La respiracion de suelo con diferencia significativa (p=0,0046), presento mayor liberacion en SM seguido SB y SA (1,0, 0,9 y 0,8 μmoles CO2/s, respectivamente). En la relacion de variables, el carbono almacenado entre COS y necromasa fue mayor en SM seguido de SA y SB (188,4, 128,6 y 119,2 t C/ha, respectivamente). La respiracion de suelo presento relacion directa con la covariable humedad relativa, con un valor mayor en SM seguidos de SB y SA (77,1, 76,0 y 74,4 mbar, respectivamente). La respiracion de suelo fue mayor en el sistema SM, muy similar en el sistema SB; sin embargo, SM presento un flujo de 13 carbono mas activo, con mayor estabilidad de temperatura de suelo y ambiente, alto COS lo cual se relaciona con la presencia de los arboles que generan la sombra en el sistema. Por ultimo, durante los tres meses de muestreo de respiracion de suelo, la emision de CO2 se redujo en el mes con menos horas luz. El almacenamiento de carbono y la respiracion de suelo afectados por el dosel de sombra presentaron diferencias altamente significativas, donde los suministros organicos al suelo y la inmovilizacion de carbono en la necromasa fueron fluctuaciones importantes en la reduccion de las emisiones de CO2 atmosferico. Estos resultados permiten concluir que el dosel de sombra afecta el positivamente el almacenamiento de carbono y la reduccion de la respiracion en suelos, donde los sistemas de sombra media son los que mas favorecen en contraste con los otros dos sistemas a la mitigacion y adaptacion al cambio climatico al mejorar la calidad del suelo como sumidero de carbono y evitar su degradacion.