El aumento en la tasa de secuencias biologicas reportadas en las bases de datos, a partir de los procesos de secuenciacion y por tanto del crecimiento de las listas de genes de organismos cuyo genoma ha sido secuenciado, contrasta con el poco conocimiento sobre la manera en que esos genes son regulados. En la presente investigacion, se elaboro un programa en lenguaje PERL, para la localizacion de secuencias de ADN que se unen a factores de transcripcion que regulan la expresion genica en procariotas. Los conjuntos de genes fueron obtenidos a partir de su expresion (micro arreglos) bajo las mismas condiciones ambientales. El organismo modelo con el que se trabajo fue lactococcus Iactis, del cual se dispone su genoma secuenciado en formato del banco de genes. El programa encontro mayor numero de posibles secuencias reguladoras en la region flanqueadora 5’ de los genes. El numero de posibles secuencias reguladoras tambien estuVo determinado por la cantidad de genes que conformaron cada conjunto. El programa tambien localizo secuencias flanqueadoras de genes que podrian estar involucradas en su regulacion, pero a niVel traduccional. La comparacion de los resultados con patrones obtenidos experimentalmente, se hizo mediante matrices de pesos de posicion de nucleotidos, obteniendose aproximadamente un 50 % de secuencias reguladoras que coincidian con las reportadas en las bases de datos, lo que indica un buen niVel de prediccion del programa si se tiene en cuenta que la mayoria de secuencias reguladoras para procariotas, aun no han sido caracterizadas por metodos experimentales.