En la cuenca del rio Cuduyari en el departamento del Vaupes, habitan dos de las 13 especies de nutrias que existen alrededor del mundo; una de estas especies es la nutria gigante o Pteronura brasiliensis, que se encuentra en peligro de extincion (EN) a nivel nacional e internacional y la nutria neotropical o Lontra longicaudis catalogada como vulnerable (VU) en el territorio nacional. Debido a este estado de amenaza, la Corporacion para el Desarrollo Sostenible del Norte y Oriente Amazonico (CDA) decidio generar un Plan de Manejo para conservacion de estas especies coordinado de manera participativa con las comunidades locales. Este trabajo se realizo de manera conjunta entre la CDA y la Fundacion Omacha, abarcando un area de 138 km desde la ciudad de Mitu hasta los limites de la comunidad de Pacu. Se obtuvieron 55 registros entre directos e indirectos para la especie P. brasiliensis. El tipo de registro que presento mayor frecuencia aparicion fueron las madrigueras con 19 (34,55%), avistamientos directos 9 (16,4%) y letrinas 27 (48,8%). La especie Lontra longicaudis presento 18 registros donde los avistamientos directos aportaron 10 (55,1%) y encuentro de madrigueras 11 (44,5%). Adicionalmente se hicieron talleres participativos con las comunidades indigenas de la etnia Cubeo donde se establecieron niveles de conflicto entre las nutrias y las pesquerias locales de subsistencia. Las evaluaciones biologicas realizadas y los aportes de las comunidades fueron los insumos principales que permitieron la construccion del Plan de Manejo de estas especies con acciones especificas para los proximos 10 anos.